History of the church
V roce 1635 chrám přišel do držení benediktinů z kláštera Emauzy, který zde začal budovat klášter. Budování klášteru trvalo od roku 1727 do roku 1730, soubor prací byl počatý v novém chrámu, který byl nakonec dokončený v roce 1735.
Plány chrámu byly vypracované slavným pražským barokním architektem Kilianem Ignácem Dienzenhoferem. Chrám sv. Mikuláše na Starém Městě je jednou z jeho vrcholných prací. Složitost uspořádání jeho vnitřku, společně s jeho zajímavým světelným schématem vytváří jeden z nejvíce podnětných církevních interiérů v Praze.
Umělecká výzdoba
Štukatura je dílem Bernarda Spinettiho, zatímco fresky ve sponě a sboru slavení sv. Mikuláše a sv. Benedikta zobrazující scény ze Starého testamentu. Byly malované bavorský umělcem Cosmasem D. Assamem v roce 1735 – 36. Skulptury dekorující zevnějšek jsou dílem pražské dílny Antonina Brauna.
Varhany
Chrámové varhany pocházejí z druhé třetiny 18. století a původně byly v jezuitském kostele v Bohosudově.